孕早期染色体异常的胎儿会自己流产。在孕早期，如果胎儿染色体异常严重，可能会导致自然流产。这种情况通常发生在早期妊娠(通常在怀孕8周之前)，在这种情况下，女性的身体可能会承认胚胎的染色体异常，并通过自然流产的方式将异常胚胎排出体外，以保护女性的身体免受进一步的风险。但每个人的情况不同，有些人也可能不会流产。

染色体异常的胎儿可能会有不同的结果，取决于具体的染色体异常类型和严重程度。一般染色体异常的胎儿不仅可能会自己流产，还可能会患上染色体相关的疾病。

1. 自然流产：一些染色体异常可能导致胚胎在早期发育时停止发育，这可能会引发自然流产。身体会自然识别染色体异常的胚胎，并通过自然流产将其排出，以减少进一步的健康风险；

2. 患有染色体疾病：染色体异常也可能导致出生的婴儿患上染色体疾病，如唐氏综合征、爱德华氏综合征、克里格尔-纳威症候群等。这些疾病可能导致智力发育受限、生理畸形、生长延迟等问题。

需要强调的是，并不是所有染色体异常都会导致流产或疾病。许多人携带染色体异常，但可以完全正常生活。染色体异常是否会导致流产或者患有染色体疾病取决于染色体的具体变化以及其对发育的影响程度。