怀孕三个月后没有经过医生的允许自行停肝素可能会导致胎停。目前在临床上用肝素来安胎治疗，主要是通过肝素减少微血栓的形成，这样来达到安胎的目的。怀孕期间停止使用肝素这样的药物应该在医生的指导下进行，自行停止使用肝素可能会增加胎停的风险，这可能会对胎儿和母亲的健康造成危险。因此，如果您怀孕并正在接受肝素治疗，一定要在咨询医生的情况下调整药物的使用。

肝素是一种抗凝剂，常用于预防血栓形成和治疗心血管疾病。怀孕后也可以使用肝素来保胎，很多人比较关心怀孕三个月后停肝素是否会导致胎停，其实这是分具体的情况的，下面就来看看。

1、不会：对于孕妇纯粹存在凝血功能增强的情况，可能会对胚胎或胎儿发育产生影响。一般情况下，医生可能会使用低分子量肝素钠注射液或低分子量肝素钙注射液进行保胎治疗。经过治疗成功后，医生会进行专业评估，若孕妇的凝血功能恢复至正常范围内，对胚胎或胎儿发育没有明显影响，通常会建议停止用药，这种情况下一般不会导致胎停；

2、会：孕妇若患有易栓症，可能会在子宫和胎盘血管内形成微血栓，通常需使用低分子量肝素钠注射液或低分子量肝素钙注射液进行保胎治疗。由于易栓症难以治愈，治疗通常需要持续至足月分娩。若在此期间过早停药，可能导致子宫和胎盘血管栓塞，进而导致胎儿缺血缺氧，可能导致胎停。

因此，停用肝素是否会导致胎停还取决于孕妇的具体情况。如果孕妇有血栓形成风险，医生可能会建议继续使用肝素，如果孕妇需要停止肝素的使用，医生可能会在停药前进行综合评估，以确定是否需要采取其他措施来降低血栓形成风险。